Account IMAP o POP3? Accedi allo stesso account anche da altre posizioni (webmail, smartphone, app)?

Accont IMAP, si accedo da altre posizioni. In quel momento ero solo in negozio per cui nessuno oltre me era al pc. Ricordo che ho toccato l'invio sulla tastiera ed improvvisamente sono sparite quasi 3000 email.

Senza sapere esattamente cosa hai fatto... è difficile aiutarti. Se non lo hai già fatto, verifica se le mail sono nel cestino. Verifica anche se per caso sono ancora disponibile tramite webmail. Come ultima opzione prova a seguire il metodo descritto qui adattandolo al tuo caso -> https://support.mozilla.org/it/questions/1378215#answer-1508370

Ho fatto tutte le ricerche ma i messaggi si sono volatilizzati. Ovviamente essendo in IMAP non ci sono neanche nella web mail di Aruba, che a sua volta ha fatto dei controlli e non ha trovato nulla di anomalo. Seguendo la guida mi trovo in questa situazione ( allego il file ) Nella cartella default c'è un solo file. E' normale?

probabilmente la posta sta nella cartella xxxxxxxx.default-realease o xxxxxxxx-default-realease-1 Puoi comunque trovare l'esatto percorso del profilo come spiegato qui -> https://support.mozilla.org/it/kb/profili-thunderbird

C'è un file di backup che il programma effettua in automatico? Quali sono i file che contengono la posta? Grazie.

No non ci sono backup automatici. Come individuare i file che contengono la posta è spiegato nella guida che ti ho indicato.